Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hps5P59438 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps5P59438 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hps5P59438 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hps5P59438 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Hps5P59438 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hps5P59438 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps5P59438 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hps5P59438 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hps5P59438 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms