Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nup43P59235 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nup43P59235 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup43P59235 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nup43P59235 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nup43P59235 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup43P59235 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup43P59235 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Nup43P59235 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms