Protein–RNA interactions for Protein: P58771

Tpm1, Tropomyosin alpha-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm1P58771 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpm1P58771 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tpm1P58771 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tpm1P58771 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpm1P58771 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms