Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Setd4P58467 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd4P58467 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd4P58467 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Setd4P58467 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Setd4P58467 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd4P58467 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd4P58467 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd4P58467 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Setd4P58467 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd4P58467 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Setd4P58467 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd4P58467 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Setd4P58467 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms