Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Uchl4P58321 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Uchl4P58321 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl4P58321 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl4P58321 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms