Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irf5P56477 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf5P56477 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf5P56477 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irf5P56477 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf5P56477 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf5P56477 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf5P56477 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irf5P56477 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irf5P56477 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Irf5P56477 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf5P56477 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Irf5P56477 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Irf5P56477 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf5P56477 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Irf5P56477 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms