Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CtskP55097 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CtskP55097 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CtskP55097 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtskP55097 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtskP55097 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CtskP55097 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtskP55097 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtskP55097 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtskP55097 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CtskP55097 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtskP55097 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CtskP55097 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CtskP55097 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtskP55097 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtskP55097 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CtskP55097 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtskP55097 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtskP55097 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtskP55097 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtskP55097 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtskP55097 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtskP55097 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtskP55097 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtskP55097 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtskP55097 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtskP55097 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtskP55097 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtskP55097 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtskP55097 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtskP55097 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtskP55097 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtskP55097 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtskP55097 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtskP55097 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtskP55097 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtskP55097 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtskP55097 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtskP55097 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtskP55097 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtskP55097 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtskP55097 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CtskP55097 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtskP55097 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtskP55097 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtskP55097 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtskP55097 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtskP55097 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtskP55097 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtskP55097 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CtskP55097 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CtskP55097 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtskP55097 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtskP55097 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtskP55097 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtskP55097 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtskP55097 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtskP55097 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtskP55097 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtskP55097 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtskP55097 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtskP55097 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtskP55097 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtskP55097 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtskP55097 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtskP55097 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtskP55097 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtskP55097 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtskP55097 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CtskP55097 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtskP55097 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtskP55097 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtskP55097 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CtskP55097 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CtskP55097 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms