Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ephb3P54754 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ephb3P54754 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ephb3P54754 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ephb3P54754 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms