Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nub1P54729 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Nub1P54729 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nub1P54729 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nub1P54729 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Nub1P54729 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nub1P54729 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nub1P54729 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nub1P54729 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nub1P54729 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nub1P54729 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms