Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Efna1P52793 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna1P52793 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna1P52793 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Efna1P52793 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Efna1P52793 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efna1P52793 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms