Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ube2e3P52483 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2e3P52483 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2e3P52483 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms