Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc1a1P51906 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc1a1P51906 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a1P51906 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a1P51906 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc1a1P51906 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc1a1P51906 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc1a1P51906 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc1a1P51906 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms