Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XpcP51612 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XpcP51612 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XpcP51612 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XpcP51612 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XpcP51612 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XpcP51612 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XpcP51612 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XpcP51612 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
XpcP51612 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XpcP51612 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XpcP51612 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
XpcP51612 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XpcP51612 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XpcP51612 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XpcP51612 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XpcP51612 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XpcP51612 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XpcP51612 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XpcP51612 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
XpcP51612 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XpcP51612 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XpcP51612 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XpcP51612 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XpcP51612 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XpcP51612 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XpcP51612 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XpcP51612 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
XpcP51612 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XpcP51612 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XpcP51612 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XpcP51612 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XpcP51612 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XpcP51612 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XpcP51612 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XpcP51612 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XpcP51612 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XpcP51612 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XpcP51612 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XpcP51612 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XpcP51612 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XpcP51612 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
XpcP51612 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XpcP51612 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XpcP51612 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XpcP51612 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
XpcP51612 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XpcP51612 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XpcP51612 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XpcP51612 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XpcP51612 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
XpcP51612 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XpcP51612 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XpcP51612 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XpcP51612 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
XpcP51612 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XpcP51612 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XpcP51612 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XpcP51612 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
XpcP51612 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
XpcP51612 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XpcP51612 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XpcP51612 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XpcP51612 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XpcP51612 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XpcP51612 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XpcP51612 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
XpcP51612 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XpcP51612 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XpcP51612 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XpcP51612 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XpcP51612 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms