Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MipP51180 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MipP51180 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MipP51180 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MipP51180 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MipP51180 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MipP51180 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MipP51180 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MipP51180 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MipP51180 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MipP51180 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MipP51180 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MipP51180 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MipP51180 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MipP51180 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MipP51180 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MipP51180 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MipP51180 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MipP51180 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MipP51180 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MipP51180 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MipP51180 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MipP51180 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MipP51180 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MipP51180 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MipP51180 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MipP51180 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MipP51180 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MipP51180 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MipP51180 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MipP51180 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MipP51180 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MipP51180 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MipP51180 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MipP51180 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MipP51180 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MipP51180 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MipP51180 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MipP51180 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MipP51180 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MipP51180 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MipP51180 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MipP51180 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MipP51180 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MipP51180 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MipP51180 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MipP51180 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MipP51180 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MipP51180 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MipP51180 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MipP51180 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MipP51180 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MipP51180 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MipP51180 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MipP51180 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MipP51180 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MipP51180 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MipP51180 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MipP51180 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MipP51180 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms