Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lhx3P50481 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lhx3P50481 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lhx3P50481 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms