Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atoh1P48985 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atoh1P48985 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh1P48985 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atoh1P48985 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Atoh1P48985 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atoh1P48985 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms