Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prox1P48437 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prox1P48437 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prox1P48437 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prox1P48437 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Prox1P48437 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prox1P48437 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms