Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SrprbP47758 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SrprbP47758 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrprbP47758 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrprbP47758 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SrprbP47758 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SrprbP47758 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SrprbP47758 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrprbP47758 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SrprbP47758 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrprbP47758 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrprbP47758 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SrprbP47758 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SrprbP47758 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrprbP47758 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrprbP47758 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SrprbP47758 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SrprbP47758 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SrprbP47758 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms