Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TesP47226 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TesP47226 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TesP47226 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TesP47226 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TesP47226 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TesP47226 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TesP47226 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TesP47226 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TesP47226 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TesP47226 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TesP47226 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TesP47226 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TesP47226 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TesP47226 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TesP47226 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TesP47226 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TesP47226 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TesP47226 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TesP47226 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TesP47226 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TesP47226 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TesP47226 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TesP47226 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TesP47226 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TesP47226 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TesP47226 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TesP47226 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TesP47226 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TesP47226 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TesP47226 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TesP47226 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TesP47226 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TesP47226 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TesP47226 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TesP47226 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TesP47226 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TesP47226 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TesP47226 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TesP47226 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TesP47226 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TesP47226 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TesP47226 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TesP47226 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TesP47226 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TesP47226 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TesP47226 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TesP47226 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TesP47226 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TesP47226 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TesP47226 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TesP47226 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TesP47226 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TesP47226 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TesP47226 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TesP47226 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TesP47226 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TesP47226 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TesP47226 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TesP47226 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TesP47226 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TesP47226 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TesP47226 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TesP47226 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TesP47226 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms