Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rab11bP46638 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab11bP46638 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rab11bP46638 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms