Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sdc2P43407 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sdc2P43407 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sdc2P43407 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdc2P43407 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdc2P43407 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms