Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtgirP43252 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtgirP43252 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtgirP43252 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PtgirP43252 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgirP43252 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PtgirP43252 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgirP43252 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgirP43252 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgirP43252 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgirP43252 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PtgirP43252 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms