Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nkx2-5P42582 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nkx2-5P42582 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nkx2-5P42582 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nkx2-5P42582 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms