Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik2P39087 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik2P39087 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik2P39087 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik2P39087 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik2P39087 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik2P39087 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik2P39087 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik2P39087 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Grik2P39087 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik2P39087 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Grik2P39087 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik2P39087 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Grik2P39087 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms