Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Grin2aP35436 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Grin2aP35436 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Grin2aP35436 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Grin2aP35436 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Grin2aP35436 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Grin2aP35436 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Grin2aP35436 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms