Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab20P35295 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rab20P35295 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rab20P35295 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab20P35295 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab20P35295 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rab20P35295 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab20P35295 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab20P35295 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab20P35295 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rab20P35295 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab20P35295 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab20P35295 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms