Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab17P35292 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab17P35292 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab17P35292 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab17P35292 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab17P35292 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab17P35292 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab17P35292 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms