Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab23P35288 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rab23P35288 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab23P35288 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab23P35288 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rab23P35288 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rab23P35288 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rab23P35288 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab23P35288 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rab23P35288 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab23P35288 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rab23P35288 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rab23P35288 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms