Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pola2P33611 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pola2P33611 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola2P33611 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola2P33611 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola2P33611 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola2P33611 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pola2P33611 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola2P33611 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pola2P33611 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms