Protein–RNA interactions for Protein: P32240

Ptger4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger4P32240 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ptger4P32240 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptger4P32240 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptger4P32240 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ptger4P32240 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptger4P32240 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms