Protein–RNA interactions for Protein: P30275

Ckmt1, Creatine kinase U-type, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckmt1P30275 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ckmt1P30275 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ckmt1P30275 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ckmt1P30275 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ckmt1P30275 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms