Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Msr1P30204 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Msr1P30204 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msr1P30204 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msr1P30204 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Msr1P30204 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Msr1P30204 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msr1P30204 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msr1P30204 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Msr1P30204 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Msr1P30204 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Msr1P30204 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msr1P30204 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msr1P30204 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Msr1P30204 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msr1P30204 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Msr1P30204 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms