Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Cnga1P29974 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Cnga1P29974 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Cnga1P29974 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Cnga1P29974 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cnga1P29974 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms