Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif3aP28741 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif3aP28741 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kif3aP28741 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms