Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxd9P28357 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxd9P28357 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxd9P28357 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd9P28357 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms