Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtsgP28293 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsgP28293 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsgP28293 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtsgP28293 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsgP28293 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtsgP28293 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms