Protein–RNA interactions for Protein: P28236

Gja8, Gap junction alpha-8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja8P28236 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gja8P28236 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gja8P28236 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gja8P28236 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja8P28236 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gja8P28236 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja8P28236 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja8P28236 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gja8P28236 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja8P28236 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gja8P28236 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gja8P28236 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.2 ms