Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-DMaP28078 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-DMaP28078 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
H2-DMaP28078 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
H2-DMaP28078 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1557.4 ms