Protein–RNA interactions for Protein: P28063

Psmb8, Proteasome subunit beta type-8, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb8P28063 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb8P28063 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psmb8P28063 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Psmb8P28063 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb8P28063 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms