Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pde6aP27664 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pde6aP27664 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pde6aP27664 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pde6aP27664 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pde6aP27664 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms