Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
H2afxP27661 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afxP27661 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afxP27661 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
H2afxP27661 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afxP27661 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afxP27661 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afxP27661 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afxP27661 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
H2afxP27661 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afxP27661 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
H2afxP27661 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
H2afxP27661 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afxP27661 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
H2afxP27661 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afxP27661 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
H2afxP27661 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms