Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SarsP26638 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SarsP26638 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SarsP26638 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SarsP26638 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SarsP26638 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SarsP26638 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SarsP26638 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SarsP26638 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SarsP26638 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SarsP26638 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SarsP26638 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SarsP26638 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SarsP26638 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SarsP26638 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SarsP26638 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SarsP26638 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SarsP26638 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarsP26638 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarsP26638 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarsP26638 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarsP26638 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SarsP26638 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SarsP26638 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SarsP26638 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SarsP26638 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SarsP26638 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SarsP26638 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SarsP26638 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SarsP26638 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SarsP26638 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SarsP26638 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SarsP26638 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SarsP26638 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SarsP26638 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SarsP26638 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SarsP26638 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SarsP26638 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SarsP26638 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SarsP26638 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SarsP26638 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarsP26638 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarsP26638 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarsP26638 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarsP26638 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarsP26638 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SarsP26638 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SarsP26638 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SarsP26638 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SarsP26638 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarsP26638 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SarsP26638 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SarsP26638 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SarsP26638 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SarsP26638 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarsP26638 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarsP26638 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarsP26638 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarsP26638 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SarsP26638 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SarsP26638 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SarsP26638 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SarsP26638 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SarsP26638 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SarsP26638 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SarsP26638 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SarsP26638 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SarsP26638 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarsP26638 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SarsP26638 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms