Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af2P26369 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af2P26369 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2af2P26369 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af2P26369 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
U2af2P26369 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af2P26369 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af2P26369 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af2P26369 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af2P26369 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af2P26369 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af2P26369 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af2P26369 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af2P26369 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.3 ms