Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
UbtfP25976 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
UbtfP25976 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
UbtfP25976 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.78■■■■□ 3
UbtfP25976 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
UbtfP25976 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
UbtfP25976 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UbtfP25976 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UbtfP25976 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UbtfP25976 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UbtfP25976 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
UbtfP25976 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
UbtfP25976 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
UbtfP25976 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
UbtfP25976 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
UbtfP25976 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
UbtfP25976 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UbtfP25976 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
UbtfP25976 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
UbtfP25976 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.97
UbtfP25976 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
UbtfP25976 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
UbtfP25976 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UbtfP25976 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
UbtfP25976 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
UbtfP25976 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UbtfP25976 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
UbtfP25976 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms