Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo2P25801 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo2P25801 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmo2P25801 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo2P25801 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms