Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccnd1P25322 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd1P25322 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccnd1P25322 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccnd1P25322 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccnd1P25322 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccnd1P25322 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms