Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tnfrsf1bP25119 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tnfrsf1bP25119 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tnfrsf1bP25119 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tnfrsf1bP25119 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms