Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria2P23819 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gria2P23819 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gria2P23819 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria2P23819 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gria2P23819 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria2P23819 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria2P23819 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gria2P23819 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria2P23819 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gria2P23819 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gria2P23819 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gria2P23819 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gria2P23819 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gria2P23819 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gria2P23819 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms