Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mdm2P23804 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mdm2P23804 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mdm2P23804 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mdm2P23804 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mdm2P23804 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mdm2P23804 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mdm2P23804 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mdm2P23804 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mdm2P23804 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mdm2P23804 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.7 ms