Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkchP23298 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkchP23298 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkchP23298 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkchP23298 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkchP23298 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkchP23298 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkchP23298 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkchP23298 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms